Indre Missions venner har gennem historien medvirket i etableringen af mange kirkelige initiativer. Flere af disse har udviklet sig til selvstændige kirkelige institutioner og en del har bevaret en særlig tilknytning til Indre Mission. Det vil sige, at Indre Mission er repræsenteret i bestyrelsen og en del af deres bagland.

De seneste år har Indre Mission også medvirket i oprettelsen af både valg- og frimenigheder, og nogle af disse har valgt en formel tilknytning til Indre Mission.